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琼脂糖作为凝胶电泳常用支持物，其纯度会直接影响DNA的分辨能力及电泳结果的清晰度。Agarose为高纯度的琼脂糖，通常配置成浓度为0.5～2%的琼脂糖凝胶，用于分离、鉴定核酸，如DNA鉴定、DNA限制性内切核酸酶图谱制作等。加入核酸荧光染料，使用凝胶成像扫描仪，即可观察电泳结束后的核酸条带。

• 熔胶可能会引起暴沸，需注意防止烫伤。
  
• 若使用具有致癌性的荧光染料进行凝胶核酸染色(如溴化乙锭等)，请佩戴手套。
  
• 配置好的凝胶如不立即使用，请将凝胶泡于电泳缓冲液（TAE或者TBE中）备用，避免凝胶干裂。

• 依据目的核酸片段大小及电泳缓冲液类型，确定所需琼脂糖浓度
  

  琼脂糖浓度	理想线形DNA分辨范围（bp）
  	1×TAE	1×TBE
  0.6%	1200~15000	1200~12000
  0.8%	1000~10000	1000~12000
  1.0%	200~10000	100~10000
  1.2%	100~8000	100~5000
  1.5%	100~5000	50~3000
  2.0%	50~3000	50~3000
  2.5%	50~3000	50~2000

• 琼脂糖凝胶制备（以水平电泳琼脂糖凝胶制备为例）：
  
  • 根据制胶量及凝胶浓度，量取一定量的电泳缓冲液（TAE或TBE），倒入三角锥形瓶中。
    
    • 制胶缓冲液和电泳缓冲液需一致。
  • 准确称量琼脂糖，小心加入上述三角锥形瓶中。在锥形瓶的瓶口盖上牛皮纸，置于微波炉中加热熔解。加热至溶液沸腾后，请戴上防热手套，小心晃动锥形瓶，如此重复数次，直至琼脂糖完全溶解。
    
    • 琼脂糖熔解过程应采用多次短暂沸腾的方法，避免溶液过热暴沸。同时应保证琼脂糖充分完全熔解，以免造成电泳图像模糊不清。
  • 向充分熔解的琼脂糖里加入核酸染料。
    
  • 将琼脂糖溶液倒入制胶模中，然后在适当位置处插上梳子。凝胶厚度一般在3～5mm之间。
    
  • 室温下待胶凝固（大约30min~1h），置于电泳槽中进行电泳。